RegulationFootprint {SMRUCC.genomics.Data.Regprecise}

.NET clr documentation

RegulationFootprint

Description

调控关系，这个对象相当于网络之中的边对象

Declare

            
# namespace SMRUCC.genomics.Data.Regprecise
export class RegulationFootprint {
   biological_process: string;
   # motif位点到被调控的基因之间的最短距离
   distance: integer;
   effector: string;
   family: string;
   # 相似度
   identities: double;
   mode: string;
   # motif位点的基因组坐标位置
   motif: NucleotideLocation;
   # 受调控的基因的功能
   product: string;
   # 来自于RegPrecise数据库之中的调控因子注释来源
   regprecise: string;
   # 预测出来的被调控的基因
   regulated: string;
   # 预测出来的基因组之中的调控因子的基因编号
   regulator: string;
   regulog: string;
   # 这个位点所属的复制子的编号，这个属性是为了将基因组的染色体DNA和质粒DNA区分开
   replicon: string;
   # 这个位置上的序列片段数据
   sequenceData: string;
   # motif位点的预测来源
   site: string;
   # 注释来源的基因组名称
   species: string;
}

        

.NET clr type reference tree

1. use by property member motif: NucleotideLocation

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