PerturbationScale {SMRUCC.genomics.Analysis.CellPhenotype}

.NET clr documentation

PerturbationScale

Description

模型输入表达量的数值空间。

Declare

            
# namespace SMRUCC.genomics.Analysis.CellPhenotype
export class PerturbationScale extends Enum {
   # 模型输入就是线性表达量(默认值，保持与既有行为完全一致)。
   Linear: PerturbationScale = 0;

   # 模型输入是 x = log2(y + LogPseudoCount) 之后的数值(例如 log2(CPM+1))。
   # 
   # 敲降与过表达的比例必须作用在反变换之后的线性空间 y 上，再把结果变换回 x；直接对 x 乘一个比例是错的：x = 8(约 255 CPM)时 80% 敲降的 正确目标是 log2(0.2 * (2^8 - 1) + 1) = 5.68，而不是 0.2 * 8 = 1.6。
   Log2Plus1: PerturbationScale = 1;

}

        

.NET clr type reference tree

1. this class extends from Enum class: Enum
2. use by field member Linear: PerturbationScale
3. use by field member Log2Plus1: PerturbationScale

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