train.phenotype_models {metaTraits} R Documentation

训练全部表型所对应的 SVM 模型

Description

Usage

train.phenotype_models(dataset,
    kernel = "rbf",
    nrfold = 5,
    tune = "regression",
    verbose = TRUE);

Arguments

dataset

由 metaTraitsTool.phenotype_problem() 装配出来的训练数据集. [as TraitTrainingSet]

kernel

核函数类型：rbf（默认）/ linear / poly / sigmoid. [as string]

nrfold

交叉验证的折数. [as integer]

tune

网格搜索的作用范围：regression 表示只对数值型表型做搜索（默认，开销很小）， none 表示全部使用默认参数，all 表示对全部表型做搜索（分类型表型 在部分网格点上收敛极慢，耗时可能达到分钟级）. [as string]

verbose

是否输出训练日志. [as boolean]

Details

Authors

metagenomics_kit

Value

this function returns data object of type ModelLoader.

clr value class

Examples

[Package metaTraits version 1.0.0.0 Index]