AlignmentBlock {SMRUCC.genomics.Visualize.SyntenyVisualize}

.NET clr documentation

AlignmentBlock

Description

代表一个单独的比对块。

Declare

            
# namespace SMRUCC.genomics.Visualize.SyntenyVisualize
export class AlignmentBlock {
   # 描述该比对区域内具体差异的整数列表。
   Deltas: integer;
   # 比对区域内的错误总数 (错配 + 插入缺失)。
   Errors: integer;
   # 获取一个值，指示该比对是否为反向互补比对。
   #  如果 QStart > QEnd，则为反向互补。
   IsReverseComplement: boolean;
   # 查询序列上的结束位置 (1-based inclusive)。
   QEnd: integer;
   # 查询序列上的起始位置 (1-based inclusive)。
   QStart: integer;
   # 获取查询序列上比对区域的长度。
   QueryAlignmentLength: integer;
   # 获取参考序列上比对区域的长度。
   ReferenceAlignmentLength: integer;
   # 参考序列上的结束位置 (1-based inclusive)。
   REnd: integer;
   # 参考序列上的起始位置 (1-based inclusive)。
   RStart: integer;
   # 比对区域内相似碱基的数量。
   Similarity: integer;
   # 终止符，通常为 0。
   Stop: integer;
}

        

.NET clr type reference tree

this clr type has no other .net clr type reference.

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