InteractExports {SMRUCC.genomics.Data.STRING} | .NET clr documentation |
对于LinkAction和linksDetail而言,都是从ftp服务器上面下载的结果数据 这个tsv文件则是搜索蛋白质网络结果之后的export下载数据的文件格式读取对象
这个数据模型是使用STRING的蛋白编号作为节点编号的
# namespace SMRUCC.genomics.Data.STRING
export class InteractExports {
automated_textmining: string;
coexpression: string;
combined_score: double;
database_annotated: string;
experimentally_determined_interaction: string;
gene_fusion: string;
homology: string;
neighborhood_on_chromosome: string;
node1: string;
# 可以在uniprot注释数据之中的entry.dbReferences找得到STRING
编号
node1_external_id: string;
node1_string_internal_id: string;
node2: string;
# 可以在uniprot注释数据之中的entry.dbReferences找得到STRING
编号
node2_external_id: string;
node2_string_internal_id: string;
phylogenetic_cooccurrence: string;
}