| entry {SMRUCC.genomics.Assembly.KEGG.WebServices.KGML} | .NET clr documentation |
Network nodes
<entry>元素表示通路中的一个“节点”或“条目”，是构建代谢网络图的基本单元。每个<entry>都有一个唯一的ID（通过id属性指定）和一个或多个名称（通过name属性指定）， 以及该条目的类型（通过type属性指定）。根据type的不同，<entry>可以代表不同类型的生物学实体。
每个<entry>元素的核心作用是定义通路中的一个节点实体。例如，在糖酵解通路中，一个<entry>可以表示己糖激酶（基因/酶），另一个可以表示葡萄糖-6-磷酸（代谢物）。 节点之间通过<reaction>和<relation>元素连接，从而形成网络。
# namespace SMRUCC.genomics.Assembly.KEGG.WebServices.KGML
export class entry {
# 一个或多个<graphics>子元素，用于描述该条目在官方通路图中的图形表示。
graphics: graphics;
# 该条目的唯一标识符（在当前通路中唯一），是一个正整数。
id: string;
# 可选属性，提供该条目在KEGG数据库中的链接地址（例如基因或化合物的详情页面）。
link: string;
# 该条目对应的KEGG数据库标识符，通常以“数据库:ID”的形式表示。例如，name="hsa:124"表示人类基因ID 124，name="cpd:C00031"表示化合物C00031（葡萄糖）。name属性可以包含多个值（多个基因或化合物），多个值之间用空格分隔。
name: string;
# 可选属性，对于某些基因/酶类型的节点，可以指定其催化或参与的化学反应ID（例如reaction="rn:R00710"）。这通常用于酶节点，以表示该酶参与的反应。
reaction: string;
# 条目的类型，如gene、compound等，用于标识该节点的生物学类别。entry的类别包括有：
#
#
#
# - gene：表示基因产物（通常是蛋白质），是代谢通路中的酶或其它蛋白质因子。
# - enzyme：表示酶（有时与gene类似，但在参考通路中特指以EC编号表示的酶）。
# - ortholog：表示直系同源群（以KO编号表示），在参考通路中代表一个保守的功能模块，可能在具体生物体中由一个或多个基因编码。
# - compound：表示化学代谢物，是代谢反应的底物或产物。
# - map：表示另一个通路的链接，相当于一个嵌套的子图节点（通常用于连接相关的通路图）。
# - other：其它未分类的节点类型。
#
type: string;
}
graphics: graphics