psRNATarget {SMRUCC.genomics.Analysis.SequenceAlignment.siRNAHit}

.NET clr documentation

psRNATarget

Description

psRNATarget 小RNA靶标预测算法实现。

采用反向互补比对：miRNA 经 RNA 反向互补后作为正向 query 与 mRNA 做 Smith-Waterman 局部比对，再依据位置加权罚分体系计算期望值（Expectation）。 期望值越低代表互补质量越好。 支持 V1（2011）/ V2（2017，默认）两套 Schema。

Declare

            
# namespace SMRUCC.genomics.Analysis.SequenceAlignment.siRNAHit
export class psRNATarget {
   # 靶标可及性评估器（UPE），默认关闭。
   Accessibility: IAccessibilityEvaluator;
   MaxExpectation: double;
   MinHitLength: integer;
   Version: Schema;
}

        

.NET clr type reference tree

1. use by property member Accessibility: IAccessibilityEvaluator
2. use by property member Version: Schema

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