BlastnMapTable {SMRUCC.genomics.Analysis.SequenceAlignment.siRNAHit}

.NET clr documentation

BlastnMapTable

Description

Declare

            
# namespace SMRUCC.genomics.Analysis.SequenceAlignment.siRNAHit
export class BlastnMapTable {
   bitscore: double;
   evalue: double;
   # 该 HSP 是否命中在 subject 的负链上（BLASTN 的 sstrand = "minus"）。
   IsMinus: boolean;
   length: integer;
   qend: integer;
   qseq: string;
   qseqid: string;
   qstart: integer;
   send: integer;
   # 靶位点在 mRNA 正义链上的结束坐标（1-based，恒大于等于 BlastnMapTable.SiteStart）。
   SiteEnd: integer;
   # 靶位点在 mRNA 正义链上的跨度（nt）。
   SiteLength: integer;
   # 靶位点在 mRNA 正义链上的起始坐标（1-based，恒小于等于 BlastnMapTable.SiteEnd）。
   SiteStart: integer;
   sseq: string;
   sseqid: string;
   sstart: integer;
   sstrand: string;
}

        

.NET clr type reference tree

this clr type has no other .net clr type reference.

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