DataFrameRow {SMRUCC.genomics.Analysis.HTS.DataFrame}

.NET clr documentation

DataFrameRow

Description

The gene expression data samples file. (基因的表达数据样本)

the gene expression model implements the IVector model, could be converts a vector.

Declare

            
# namespace SMRUCC.genomics.Analysis.HTS.DataFrame
export class DataFrameRow {
   # This gene's expression value in the different experiment condition.
   experiments: double;
   # The unique reference id of current expression data vector
   geneID: string;
   # MAD（Median Absolute Deviation，中位数绝对偏差）是一种鲁棒的统计量，用于衡量单变量数据的离散程度。其核心思想是通过中位数计算偏差，避免异常值对结果的影响。数学定义为：
   # 
   # 
 MAD=median(∣Xi−median(X)∣)
   # 
   # 
   # 
   #  
   #  其中 X表示基因在所有样本中的表达值向量，Xi为单个样本的表达值，median(X)是基因表达值的中位数。
   #  与标准差不同，MAD使用中位数而非均值，因此不受极端值干扰。例如，若某基因在多数样本中表达稳定，但个别样本异常高/低，标准差会显著增大，而MAD几乎不变。
   #  
   #  WGCNA等共表达网络分析中，需筛选高变异基因（如取MAD值最高的前5000个基因）。高MAD值表明基因表达在样本间波动大，可能具有生物学意义（如调控关键通路）。
   MAD: double;
   # Gets the sample counts of current gene expression data.(获取基因表达数据样本数目)
   samples: integer;
}

        

.NET clr type reference tree

this clr type has no other .net clr type reference.

---