| set_log_offset {linear} |
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设置模型空间的整体对数偏移量(去全局因子之后的 context 需要)。
Description
<br /> 拟合矩阵做过"逐样本减去跨基因均值"之后,模型空间是<br /> x' = log2(CPM + 1) - offset;扰动幅度必须先在 x' + offset 上计算,<br /> 再换算回来,否则负基线会被压成 0,敲降变成"敲到底"甚至反号。
Usage
set_log_offset(model, offset);
Arguments
model
由 elastic_model 创建的扰动引擎. [as ElasticNet]
offset
偏移量,即该 context 的跨基因均值减去中位数校准量. [as double]
Details
Authors
TRNtoolkit
Value
同一个引擎对象,便于链式调用
clr value class
Examples
[Package
linear version 1.0.0.0
Index]